يمكن استخدام نظام الأوزون بشكل أساسي في جميع أنواع مياه الصرف الصحي.تعتمد عملية أكسدة مياه الصرف الصحي على أنواع مياه الصرف الصحي الناتجة عن الصناعات المختلفة.
تطبيق الأوزون العام: المعالجة المسبقة الداخلية لمياه ركوب الدراجات، أو تصريف المياه بشكل غير مباشر إلى مرافق المياه العامة، أو المعالجة اللاحقة للمياه ليتم تصريفها مباشرة إلى النهر والخليج.
إزالة المركب: أكسدة المادة الضارة أو الملونة، وتقليل المعلمات الشاملة (COD أو DOC).عادة، العملية تجمع بين أكسدة الأوزون والتحلل الحيوي، أي O3- المعالجة البيولوجية -O3، لخفض جرعة الأوزون وتكلفة التشغيل.