Hal-hazırda ozon təmizlənmiş su, bulaq suları, mineral sular və yeraltı suların emalında geniş istifadə olunur.Və CT=1,6 tez-tez kran suyunun təmizlənməsi üçün tətbiq edilir (C həll olunmuş ozon konsentrasiyası 0,4 mq/L, T ozonun saxlanma müddəti 4 dəqiqə deməkdir).

Ozonla təmizlənmiş içməli su viruslar, bakteriyalar və parazitlər də daxil olmaqla patogen mikroorqanizmləri öldürür və ya təsirsiz hala gətirir və çirklənmə nəticəsində su sistemlərində aşkar edilən qeyri-üzvi iz çirkləndiricilərini təmizləyir.Ozon müalicəsi həm də humik turşusu və yosun metabolitləri kimi təbii olaraq yaranan üzvi birləşmələri azaldır.Səth suları, o cümlədən göllər və çaylar, ümumiyyətlə, daha yüksək səviyyədə mikroorqanizmləri ehtiva edir.Buna görə də, onlar yeraltı sulardan daha çox çirklənməyə meyllidirlər və müxtəlif müalicə rejimləri tələb edirlər.