Trenutno se ozon najčešće koristi u prečišćenoj vodi, izvorskoj vodi, mineralnoj vodi i preradi podzemnih voda.A CT=1,6 se često primjenjuje na tretman vode iz slavine (C znači koncentracija rastvorenog ozona 0,4 mg/L, T znači vrijeme zadržavanja ozona 4 minuta).

Voda za piće tretirana ozonom ubija ili deaktivira patogene mikroorganizme uključujući viruse, bakterije i parazite i uklanja neorganske tragove zagađivača koji se nalaze u vodnim sistemima zbog zagađenja.Tretman ozonom također smanjuje prirodna organska jedinjenja kao što su huminska kiselina i metaboliti algi.Površinske vode, uključujući jezera i rijeke, općenito sadrže veći nivo mikroorganizama.Stoga su sklonije kontaminaciji od podzemnih voda i zahtijevaju različite režime tretmana.