Ozonski sistem se može koristiti u praktično svim vrstama otpadnih voda.Proces oksidacije otpadnih voda ovisi o vrsti otpadnih voda iz različitih industrija.

Opšta primjena ozona: predtretman vode u zatvorenom prostoru za ciklične vode, voda koja se indirektno ispušta u javne vodne objekte ili naknadna obrada vode koja se direktno ispušta u rijeku i zaliv.

Uklanjanje spojeva: Oksidacija štetnih ili obojenih tvari, smanjenje opsežnih parametara (COD ili DOC).Normalno, proces kombinuje oksidaciju ozona i biorazgradnju, odnosno O3-biološki tretman -O3, kako bi se smanjila doza ozona i operativni troškovi.