Amb el desenvolupament de l'aqüicultura, la malaltia causada pel microorganisme patògen es produeix ocasionalment, que perjudiquen la indústria de l'aqüicultura.Llevat de la millora de la gestió de les instal·lacions, ha estat un tema important eliminar el microorganisme patògen de l'aigua i instruments d'alimentació.L'ozó, com que és un fort oxidant, desinfectant i catalitzador, s'ha utilitzat àmpliament no només a la indústria, sinó també en la desinfecció de l'aigua, la millora de la qualitat de l'aigua i la prevenció del microorganisme patògen a l'aqüicultura i la marea vermella.El microorganisme patògen es pot prevenir utilitzant un sistema d'ozó per desinfectar l'aigua i les instal·lacions d'aqüicultura.

Com que l'ozó té una alta eficiència en la desinfecció, la purificació de l'aigua i no causa subproductes no desitjats, és el desinfectant ideal per a l'aqüicultura.La inversió d'utilitzar el sistema d'ozó en la cria d'aqüicultura no és alta, i estalvia diversos desinfectants, antibiòtics, disminueix l'aigua intercanviada, augmenta la taxa de supervivència de la cria a almenys dues vegades, produeix aliments verds i orgànics.Per tant, és força econòmic.Actualment, l'ús de l'ozó a l'aqüicultura és força habitual al Japó, Amèrica i països europeus.