Ozonový systém lze použít v podstatě ve všech druzích odpadních vod.Proces oxidace odpadních vod závisí na typech odpadních vod z různých průmyslových odvětví.

Obecná aplikace ozónu: vnitřní předúprava pro cirkulující vodu, voda, která má být nepřímo vypouštěna do veřejných vodárenských zařízení, nebo následná úprava vody, která má být přímo vypouštěna do řeky a zálivu.

Odstraňování sloučenin: Oxidace škodlivých nebo barevných látek, snížení komplexních parametrů (CHSK nebo DOC).Normálně tento proces kombinuje oxidaci ozonu a biodegradaci, jmenovitě O3-biologická úprava -O3, aby se snížilo dávkování ozonu a provozní náklady.