Otsonijärjestelmää voidaan käyttää periaatteessa kaikenlaisissa jätevesissä.Jäteveden hapetusprosessi riippuu eri teollisuudenalojen jätevesityypeistä.

Yleinen otsonisovellus: pyöräilyveden esikäsittely sisätiloissa, vesi, joka johdetaan epäsuorasti yleisiin vesilaitoksiin, tai jälkikäsittely vesille, joka johdetaan suoraan jokeen ja lahdelle.

Yhdisteen poisto: Haitallisen tai värillisen aineen hapettuminen, kattavien parametrien (COD tai DOC) vähentäminen.Normaalisti prosessissa yhdistyvät otsonin hapetus ja biohajoaminen, nimittäin O3-biologinen käsittely -O3, otsonin annostuksen ja käyttökustannusten alentamiseksi.