ओजोन प्रणाली का उपयोग मूलतः सभी प्रकार के अपशिष्ट जल में किया जा सकता है।अपशिष्ट जल ऑक्सीकरण की प्रक्रिया विभिन्न उद्योगों से निकलने वाले अपशिष्ट जल के प्रकार पर निर्भर करती है।
सामान्य ओजोन अनुप्रयोग: साइकलिंग जल के लिए इनडोर पूर्व-उपचार, सार्वजनिक जल सुविधाओं में अप्रत्यक्ष रूप से छोड़े जाने वाले पानी, या नदी और खाड़ी में सीधे छोड़े जाने वाले पानी के लिए उपचार के बाद।
यौगिक हटाना: हानिकारक या रंगीन पदार्थ का ऑक्सीकरण, व्यापक मापदंडों (सीओडी या डीओसी) को कम करना।आम तौर पर, प्रक्रिया ओजोन की खुराक और संचालन लागत को कम करने के लिए ओजोन ऑक्सीकरण और जैव-निम्नीकरण, अर्थात् O3- जैविक उपचार -O3 को जोड़ती है।