Ozonski sustav može se koristiti u gotovo svim vrstama otpadnih voda.Proces oksidacije otpadnih voda ovisi o vrstama otpadnih voda iz različitih industrija.

Opća primjena ozona: unutarnja prethodna obrada vode za kruženje, voda koja se neizravno ispušta u javne vodoopskrbne objekte ili naknadna obrada vode koja se izravno ispušta u rijeku i zaljev.

Uklanjanje spojeva: Oksidacija štetnih ili obojenih tvari, smanjenje opsežnih parametara (COD ili DOC).Obično proces kombinira oksidaciju ozona i biorazgradnju, odnosno O3- biološka obrada -O3, kako bi se smanjila doza ozona i troškovi rada.