Jelenleg az ózont általában tisztított vízben, forrásvízben, ásványvízben és felszín alatti vízfeldolgozásban használják.A CT=1,6-ot pedig gyakran alkalmazzák a csapvíz kezelésénél (C 0,4mg/L oldott ózonkoncentrációt, T 4 perces ózonretenciós időt jelent).

Az ózonnal kezelt ivóvíz elpusztítja vagy inaktiválja a kórokozó mikroorganizmusokat, beleértve a vírusokat, baktériumokat és parazitákat, és eltávolítja a vízrendszerekben a szennyezés következtében fellelhető szervetlen nyomokban előforduló szennyeződéseket.Az ózonkezelés emellett csökkenti a természetben előforduló szerves vegyületeket, például a huminsavat és az algák metabolitjait.A felszíni vizek, beleértve a tavakat és a folyókat, általában nagyobb mennyiségben tartalmaznak mikroorganizmusokat.Ezért hajlamosabbak a szennyeződésre, mint a talajvíz, és eltérő kezelési rendszert igényelnek.