Með þróun fiskeldis kemur sjúkdómurinn af völdum sjúkdómsvaldandi örveru af og til, sem skaðar fiskeldisiðnaðinn.Fyrir utan að efla stjórnun aðstöðunnar hefur það verið mikilvægt viðfangsefni að útrýma sjúkdómsvaldandi örveru í fóðurvatni og tækjum.Óson, þar sem það er sterkt oxunarefni, sótthreinsiefni og hvati, hefur verið mikið notað, ekki aðeins í iðnaðinum, heldur einnig í sótthreinsun vatns, bætt vatnsgæði og komið í veg fyrir að hágæða örvera sé í fiskeldi og fjöru.Hægt er að koma í veg fyrir sjúkdómsvaldandi örveru með því að nota ósonkerfi til að sótthreinsa fiskeldisvatn og aðstöðu.

Þar sem óson hefur mikla skilvirkni við sótthreinsun, vatnshreinsun og veldur ekki óæskilegum aukaafurðum, er það tilvalið sótthreinsiefni fyrir fiskeldi.Fjárfestingin við að nota ósonkerfi í fiskeldiseldi er ekki mikil og það sparar ýmis sótthreinsiefni, sýklalyf, dregur úr vatnsskiptum, eykur ræktunartíðni í að minnsta kosti tvöfalt, framleiðir græna og lífræna matinn.Þess vegna er það nokkuð efnahagslegt.Sem stendur er notkun ósons í fiskeldi nokkuð algeng í Japan, Ameríku og Evrópulöndum.