現在、オゾンは精製水、湧き水、ミネラルウォーター、地下水の処理に一般的に使用されています。また、CT=1.6は水道水処理によく適用されます（Cは溶存オゾン濃度0.4mg/L、Tはオゾン滞留時間4分を意味します）。

オゾンで処理された飲料水は、ウイルス、細菌、寄生虫などの病原微生物を死滅または不活化し、汚染により水系に見られる無機微量汚染物質を除去します。オゾン処理は、フミン酸や藻類の代謝物などの天然有機化合物も削減します。湖や川などの地表水には、一般に高レベルの微生物が含まれています。したがって、地下水よりも汚染されやすく、異なる処理計画が必要です。