აკვაკულტურის განვითარებასთან ერთად ზოგჯერ ხდება პათოგენური მიკროორგანიზმებით გამოწვეული დაავადება, რაც ზიანს აყენებს აკვაკულტურის ინდუსტრიას.ობიექტების მენეჯმენტის გაძლიერების გარდა, მნიშვნელოვანი საგანი იყო კვების წყალში და ინსტრუმენტებში პათოგენური მიკროორგანიზმების აღმოფხვრა.ოზონი, რადგან ის არის ძლიერი ოქსიდანტი, სადეზინფექციო და კატალიზატორი, ფართოდ გამოიყენება არა მხოლოდ მრეწველობაში, არამედ წყლის დეზინფექციაში, წყლის ხარისხის გასაუმჯობესებლად და აკვაკულტურაში და წითელ მოქცევაში ჰოგენური მიკროორგანიზმის თავიდან ასაცილებლად.პათოგენური მიკროორგანიზმის თავიდან აცილება შესაძლებელია ოზონის სისტემის გამოყენებით აკვაკულტურის წყლისა და ობიექტების დეზინფექციისთვის.
ვინაიდან ოზონს აქვს მაღალი ეფექტურობა დეზინფექციაში, წყლის გაწმენდაში და არ იწვევს არასასურველ პროდუქტს, ის იდეალური სადეზინფექციო საშუალებაა აკვაკულტურისთვის.აკვაკულტურის მოშენებაში ოზონის სისტემის გამოყენების ინვესტიცია არ არის მაღალი და დაზოგავს სხვადასხვა სადეზინფექციო საშუალებებს, ანტიბიოტიკებს, ამცირებს გაცვლებულ წყალს, ზრდის გამრავლების გადარჩენის მაჩვენებელს მინიმუმ ორჯერ, აწარმოებს მწვანე და ორგანულ საკვებს.შესაბამისად, საკმაოდ ეკონომიურია.ამჟამად ოზონის გამოყენება აკვაკულტურაში საკმაოდ გავრცელებულია იაპონიაში, ამერიკასა და ევროპის ქვეყნებში.