ამჟამად ოზონი ჩვეულებრივ გამოიყენება გაწმენდილი წყლის, წყაროს წყლის, მინერალური წყლისა და მიწისქვეშა წყლების გადამუშავებაში.და CT=1.6 ხშირად გამოიყენება ონკანის წყლის სამკურნალოდ (C ნიშნავს გახსნილი ოზონის კონცენტრაციას 0.4 მგ/ლ, T ნიშნავს ოზონის შეკავების დროს 4 წუთს).

ოზონით დამუშავებული სასმელი წყალი კლავს ან ააქტიურებს პათოგენურ მიკროორგანიზმებს, მათ შორის ვირუსებს, ბაქტერიებს და პარაზიტებს და აშორებს წყლის სისტემებში დაბინძურების გამო აღმოჩენილ არაორგანულ დამაბინძურებლებს.ოზონით მკურნალობა ასევე ამცირებს ბუნებრივ ორგანულ ნაერთებს, როგორიცაა ჰუმინის მჟავა და წყალმცენარეების მეტაბოლიტები.ზედაპირული წყლები, მათ შორის ტბები და მდინარეები, ზოგადად შეიცავს მიკროორგანიზმების მაღალ დონეს.აქედან გამომდინარე, ისინი უფრო მიდრეკილნი არიან დაბინძურებისკენ, ვიდრე მიწისქვეშა წყლები და საჭიროებენ განსხვავებულ მკურნალობას.