Қазіргі уақытта озон тазартылған суда, бұлақ суында, минералды суда және жер асты суларын өңдеуде кеңінен қолданылады.Ал CT=1,6 жиі ағынды суды тазарту үшін қолданылады (C еріген озон концентрациясы 0,4 мг/л, T озонды ұстау уақыты 4 минутты білдіреді).

Озонмен өңделген ауыз су патогенді микроорганизмдерді, соның ішінде вирустарды, бактерияларды және паразиттерді өлтіреді немесе белсендіреді және ластану салдарынан су жүйелерінде табылған бейорганикалық ізді ластаушы заттарды жояды.Озонмен өңдеу сонымен қатар гумин қышқылы мен балдыр метаболиттері сияқты табиғи органикалық қосылыстарды азайтады.Жер үсті сулары, соның ішінде көлдер мен өзендер, әдетте микроорганизмдердің жоғары деңгейінен тұрады.Сондықтан олар жер асты суларына қарағанда ластануға бейім және әртүрлі тазарту режимдерін қажет етеді.