Šiuo metu ozonas dažniausiai naudojamas išvalytam vandeniui, šaltinio vandeniui, mineraliniam vandeniui ir požeminiam vandeniui apdoroti.O CT=1,6 dažnai taikomas vandens iš čiaupo valymui (C reiškia ištirpusio ozono koncentraciją 0,4mg/L, T reiškia ozono sulaikymo laiką 4 min.).

Ozonu apdorotas geriamasis vanduo naikina arba inaktyvuoja patogeninius mikroorganizmus, įskaitant virusus, bakterijas ir parazitus, ir pašalina neorganinius teršalus, esančius vandens sistemose dėl taršos.Ozono apdorojimas taip pat sumažina natūraliai susidarančius organinius junginius, tokius kaip humino rūgštis ir dumblių metabolitai.Paviršiniuose vandenyse, įskaitant ežerus ir upes, paprastai yra daugiau mikroorganizmų.Todėl jie yra labiau užteršti nei požeminis vanduo ir reikalauja kitokio apdorojimo režimo.