Во моментов, озонот најчесто се користи во преработка на прочистена вода, изворска вода, минерална вода и подземна вода.И CT=1,6 често се применува за третман на вода од чешма (C значи концентрација на растворен озон 0,4mg/L, T значи време на задржување на озонот 4 минути).

Водата за пиење третирана со озон убива или деактивира патогени микроорганизми, вклучувајќи вируси, бактерии и паразити и ги отстранува неорганските траги контаминенти кои се наоѓаат во водните системи поради загадувањето.Третманот со озон, исто така, ги намалува природните органски соединенија како што се хуминска киселина и метаболити од алги.Површинските води, вклучувајќи ги езерата и реките, генерално содржат повисоки нивоа на микроорганизми.Затоа, тие се повеќе склони кон контаминација отколку подземните води и бараат различни режими на третман.