सध्या, ओझोनचा वापर सामान्यतः शुद्ध पाणी, स्प्रिंग वॉटर, मिनरल वॉटर आणि भूमिगत पाण्याच्या प्रक्रियेत केला जातो.आणि CT=1.6 अनेकदा टॅप वॉटर ट्रीटमेंटवर लागू केले जाते (C म्हणजे विरघळलेले ओझोन एकाग्रता 0.4mg/L, T म्हणजे ओझोन धारणा वेळ 4 मिनिटे).

ओझोनने उपचार केलेले पाणी पिण्यामुळे विषाणू, जीवाणू आणि परजीवी यासह रोगजनक सूक्ष्मजीव नष्ट होतात किंवा निष्क्रिय होतात आणि प्रदूषणामुळे पाणी प्रणालीमध्ये आढळणारे अजैविक ट्रेस दूषित पदार्थ काढून टाकतात.ओझोन उपचार नैसर्गिकरित्या उद्भवणारे सेंद्रिय संयुगे जसे की ह्युमिक ऍसिड आणि अल्गल मेटाबोलाइट्स देखील कमी करते.सरोवरे आणि नद्यांसह पृष्ठभागाच्या पाण्यामध्ये सामान्यत: उच्च पातळीचे सूक्ष्मजीव असतात.म्हणून, ते भूजलापेक्षा दूषित होण्याची अधिक शक्यता असते आणि त्यांना वेगवेगळ्या उपचार पद्धतींची आवश्यकता असते.