В настоящее время озон широко используется при обработке очищенной воды, родниковой воды, минеральной воды и подземных вод.Для очистки водопроводной воды часто применяется CT=1,6 (C означает концентрацию растворенного озона 0,4 мг/л, T означает время удержания озона 4 минуты).

Питьевая вода, обработанная озоном, убивает или инактивирует патогенные микроорганизмы, включая вирусы, бактерии и паразиты, а также удаляет неорганические следы загрязнений, обнаруженные в водных системах в результате загрязнения.Обработка озоном также уменьшает количество встречающихся в природе органических соединений, таких как гуминовые кислоты и метаболиты водорослей.Поверхностные воды, включая озера и реки, обычно содержат более высокий уровень микроорганизмов.Поэтому они более подвержены загрязнению, чем грунтовые воды, и требуют других режимов очистки.