Z razvojem ribogojstva se občasno pojavljajo bolezni, ki jih povzročajo patogeni mikroorganizmi, kar škoduje ribogojni industriji.Poleg izboljšanja upravljanja objektov je bilo pomembno odstraniti patogene mikroorganizme v napajalni vodi in instrumentih.Ozon, ki je močan oksidant, razkužilo in katalizator, se široko uporablja ne samo v industriji, ampak tudi pri dezinfekciji vode, izboljšanju kakovosti vode in preprečevanju patogenih mikroorganizmov v ribogojstvu in rdeči plimi.Patogene mikroorganizme je mogoče preprečiti z uporabo ozonskega sistema za dezinfekcijo vode in ribogojnih objektov.

Ker ima ozon visoko učinkovitost pri dezinfekciji, čiščenju vode in ne povzroča nezaželenih stranskih produktov, je idealno dezinfekcijsko sredstvo za ribogojstvo.Investicija v uporabo ozonskega sistema v ribogojni reji ni visoka in prihrani razna razkužila, antibiotike, zmanjša izmenjano vodo, vsaj dvakrat poveča stopnjo preživetja reje, proizvaja zeleno in organsko hrano.Zato je precej gospodarno.Trenutno je uporaba ozona v ribogojstvu precej razširjena na Japonskem, v Ameriki in v evropskih državah.