Ozonski sistem se lahko uporablja v skoraj vseh vrstah odpadne vode.Proces oksidacije odpadne vode je odvisen od vrste odpadne vode iz različnih industrij.

Splošna uporaba ozona: predobdelava vode v zaprtih prostorih za kroženje vode, voda, ki se posredno odvaja v javne vodne objekte, ali naknadna obdelava vode, ki se neposredno odvaja v reko in zaliv.

Odstranjevanje spojine: Oksidacija škodljive ali obarvane snovi, zmanjšanje obsežnih parametrov (COD ali DOC).Običajno postopek združuje oksidacijo ozona in biološko razgradnjo, in sicer O3-biološka obdelava -O3, da se zmanjšajo odmerjanje ozona in stroški delovanja.