Aktualisht, ozoni përdoret zakonisht në përpunimin e ujit të pastruar, ujin e burimit, ujin mineral dhe nëntokësor.Dhe CT=1.6 aplikohet shpesh për trajtimin e ujit të rubinetit (C do të thotë përqendrim i ozonit të tretur 0.4mg/L, T do të thotë kohë e mbajtjes së ozonit 4 minuta).
Uji i pijshëm i trajtuar me ozon vret ose çaktivizon mikroorganizmat patogjenë duke përfshirë viruset, bakteret dhe parazitët dhe largon ndotësit gjurmë inorganikë që gjenden në sistemet e ujit për shkak të ndotjes.Trajtimi i ozonit gjithashtu redukton përbërjet organike që ndodhin natyrshëm si acidi humik dhe metabolitët e algave.Ujërat sipërfaqësore, duke përfshirë liqenet dhe lumenjtë, në përgjithësi përmbajnë nivele më të larta të mikroorganizmave.Prandaj, ato janë më të prirura ndaj ndotjes sesa ujërat nëntokësore dhe kërkojnë regjime të ndryshme trajtimi.