För närvarande används ozon vanligen i renat vatten, källvatten, mineralvatten och underjordiskt vatten.Och CT=1,6 används ofta för behandling av kranvatten (C betyder koncentration av löst ozon 0,4mg/L, T betyder retentionstid för ozon 4 minuter).

Dricksvatten behandlat med ozon dödar eller inaktiverar patogena mikroorganismer inklusive virus, bakterier och parasiter och tar bort oorganiska spårföroreningar som finns i vattensystem på grund av föroreningar.Ozonbehandling minskar också naturligt förekommande organiska föreningar som humussyra och algmetaboliter.Ytvatten, inklusive sjöar och floder, innehåller i allmänhet högre halter av mikroorganismer.Därför är de mer benägna att förorenas än grundvatten och kräver olika behandlingsregimer.