Su ürünleri yetiştiriciliğinin gelişmesiyle birlikte, patojen mikroorganizmaların neden olduğu hastalıklar zaman zaman ortaya çıkmakta ve bu durum su ürünleri yetiştiriciliği endüstrisine zarar vermektedir.Tesis yönetiminin geliştirilmesinin yanı sıra, besleme suyu ve aletlerdeki patojen mikroorganizmaların elimine edilmesi de önemli bir konu olmuştur.Ozon, güçlü bir oksidan, dezenfektan ve katalizör olduğundan sadece endüstride değil, su dezenfeksiyonunda, su kalitesinin iyileştirilmesinde, su ürünleri yetiştiriciliğinde ve gelgitte patojen mikroorganizmaların önlenmesinde de yaygın olarak kullanılmaktadır.Su ürünleri yetiştiriciliği sularının ve tesislerinin dezenfekte edilmesi için ozon sistemi kullanılarak patojen mikroorganizma önlenebilir.

Ozon, dezenfeksiyonda, su arıtmada yüksek verimliliğe sahip olması ve istenmeyen yan ürüne neden olmaması nedeniyle su ürünleri yetiştiriciliği için ideal bir dezenfektandır.Su ürünleri yetiştiriciliğinde ozon sisteminin kullanılmasının yatırımı yüksek değildir ve çeşitli dezenfektanlardan, antibiyotiklerden tasarruf sağlar, değiştirilen suyu azaltır, üreme hayatta kalma oranını en az iki katına çıkarır, yeşil ve organik gıda üretir.Bu nedenle oldukça ekonomiktir.Günümüzde Japonya, Amerika ve Avrupa ülkelerinde ozonun su ürünleri yetiştiriciliğinde kullanımı oldukça yaygındır.