З розвитком аквакультури захворювання, викликані патогенними мікроорганізмами, трапляються час від часу, що завдає шкоди галузі аквакультури.Окрім покращення управління об’єктами, важливою була ліквідація патогенних мікроорганізмів у воді для годування та інструментах.Озон, оскільки він є сильним окислювачем, дезінфікуючим засобом і каталізатором, широко використовується не тільки в промисловості, але також для дезінфекції води, поліпшення якості води та запобігання патогенним мікроорганізмам в аквакультурі та червоному припливі.Патогенним мікроорганізмам можна запобігти, використовуючи озонову систему для дезінфекції води та об’єктів аквакультури.

Оскільки озон має високу ефективність у дезінфекції, очищенні води та не викликає небажаних побічних продуктів, він є ідеальним дезінфікуючим засобом для аквакультури.Інвестиції у використання озонової системи в розведенні аквакультури невисокі, і це економить різні дезінфікуючі засоби, антибіотики, зменшує обмін води, збільшує рівень виживання розведення принаймні вдвічі, виробляє зелену та органічну їжу.Тому це досить економічно.В даний час використання озону в аквакультурі досить поширене в Японії, Америці та країнах Європи.