آبی زراعت کی ترقی کے ساتھ، پیتھوجینک مائکروجنزم کی وجہ سے بیماری کبھی کبھار ہوتی ہے، جو آبی زراعت کی صنعت کو نقصان پہنچاتی ہے۔سہولیات کے انتظام کو بڑھانے کے علاوہ، کھانا کھلانے کے پانی اور آلات میں روگجنک مائکروجنزم کو ختم کرنا ایک اہم موضوع رہا ہے۔اوزون، کیونکہ یہ مضبوط آکسیڈینٹ ہے، جراثیم کش اور اتپریرک نہ صرف صنعت میں، بلکہ پانی کی جراثیم کشی، پانی کے معیار کو بہتر بنانے اور آبی زراعت اور سرخ جوار میں پیٹ ہوجینک مائکروجنزم کو روکنے میں بھی بڑے پیمانے پر استعمال ہوتا رہا ہے۔آبی زراعت کے پانی اور سہولیات کو جراثیم سے پاک کرنے کے لیے اوزون نظام کا استعمال کرکے روگجنک مائکروجنزم کو روکا جا سکتا ہے۔

چونکہ اوزون جراثیم کشی، پانی صاف کرنے میں اعلیٰ کارکردگی رکھتا ہے اور ناپسندیدہ ضمنی مصنوعات کا سبب نہیں بنتا، یہ آبی زراعت کے لیے مثالی جراثیم کش ہے۔آبی زراعت کی افزائش میں اوزون سسٹم کے استعمال کی سرمایہ کاری زیادہ نہیں ہے، اور یہ مختلف جراثیم کش ادویات، اینٹی بایوٹک کو بچاتا ہے، پانی کے تبادلے میں کمی لاتا ہے، افزائش نسل کو زندہ رہنے کی شرح کو کم از کم دو گنا تک بڑھاتا ہے، سبز اور نامیاتی خوراک پیدا کرتا ہے۔لہذا، یہ کافی اقتصادی ہے.اس وقت جاپان، امریکہ اور یورپی ممالک میں آبی زراعت میں اوزون کا استعمال کافی عام ہے۔