Akvakulturaning rivojlanishi bilan patogen mikroorganizmlar keltirib chiqaradigan kasallik vaqti-vaqti bilan yuzaga keladi, bu esa akvakultura sanoatiga zarar etkazadi.Ob'ektlarni boshqarishni yaxshilashdan tashqari, oziqlantiruvchi suv va asboblardagi patogen mikroorganizmlarni yo'q qilish muhim mavzu bo'ldi.Ozon, kuchli oksidlovchi, dezinfektsiyalovchi va katalizator bo'lganligi sababli, nafaqat sanoatda, balki suvni zararsizlantirish, suv sifatini yaxshilash va akvakultura va qizil to'lqinlarda pat hogenik mikroorganizmlarning oldini olishda ham keng qo'llaniladi.Akvakultura suvi va inshootlarini dezinfeksiya qilish uchun ozon tizimidan foydalanish orqali patogen mikroorganizmning oldini olish mumkin.

Ozon dezinfektsiyalashda, suvni tozalashda yuqori samaradorlikka ega va istalmagan qo'shimcha mahsulotga olib kelmasligi sababli, u akvakultura uchun ideal dezinfektsiyalash vositasidir.Baliqchilikda ozon tizimini qo'llash sarmoyasi unchalik katta emas va bu turli dezinfektsiyalash vositalarini, antibiotiklarni tejaydi, almashtiriladigan suvni kamaytiradi, naslchilikni kamida ikki baravar oshiradi, yashil va organik oziq-ovqat ishlab chiqaradi.Shunday qilib, bu juda iqtisodiy.Hozirgi vaqtda Yaponiya, Amerika va Yevropa mamlakatlarida akvakulturada ozondan foydalanish keng tarqalgan.