Với sự phát triển của nuôi trồng thủy sản, thỉnh thoảng các bệnh do vi sinh vật gây bệnh gây ra gây thiệt hại cho ngành nuôi trồng thủy sản.Ngoại trừ việc tăng cường quản lý cơ sở vật chất, việc loại bỏ vi sinh vật gây bệnh trong nước và dụng cụ nuôi dưỡng là một vấn đề quan trọng.Ozone, vì nó là chất oxy hóa, khử trùng và xúc tác mạnh đã được sử dụng rộng rãi không chỉ trong công nghiệp mà còn trong khử trùng nước, cải thiện chất lượng nước và ngăn ngừa vi sinh vật gây bệnh trong nuôi trồng thủy sản và thủy triều đỏ.Vi sinh vật gây bệnh có thể được ngăn chặn bằng cách sử dụng hệ thống ozone để khử trùng nước và cơ sở nuôi trồng thủy sản.

Vì ozone có hiệu quả cao trong việc khử trùng, lọc nước và không tạo ra các sản phẩm phụ không mong muốn nên đây là chất khử trùng lý tưởng cho nuôi trồng thủy sản.Đầu tư sử dụng hệ thống ozone trong chăn nuôi thủy sản không cao, tiết kiệm được nhiều loại thuốc khử trùng, kháng sinh, giảm thay nước, tăng tỷ lệ sống của con giống lên ít nhất gấp 2 lần, tạo ra thức ăn xanh và hữu cơ.Vì vậy, nó khá kinh tế.Hiện nay, việc sử dụng ozone trong nuôi trồng thủy sản khá phổ biến ở Nhật Bản, Mỹ và các nước châu Âu.